庭辩结束后，天帝在查看各种证据和证人证词尤其是陈情书后，最终做出裁决。紫微大帝和司命殿的核查结果确认了雷部的罪行，阻断通讯、截杀求援、勾结阐教、未得御批而私调诛龙阵是不争事实，违反天规。
最终，天帝下令严惩主谋，重组雷部职权，并追究相关责任。私调天兵的直接行为者灵焰星君处以极刑，主谋云雷应化天尊被削去神职，打入天牢。雷部整体权限受天庭监察，避免再与阐教勾结。天庭颁布新规，凡调用天兵，需经紫微大帝与天帝共同御批。以此限制阐教、截教等势力借天兵行私刑。
以此颁布旨意，昭告三界：
天帝敕令
奉天承运，昊天诏曰：
近日东海诛龙阵一案三界共鉴，经司命殿及北斗监察司彻查，已定谳结案，涉事者依天律严惩，以正天纲。现判谕如下：
一、彻查雷部僭越之罪
敕令司命殿会同北斗监察，即刻勘验雷部与玉虚宫往来的飞鹤密录、南天门出入记录，彻查其私调天兵、勾结阐教、阻断东海通讯等罪证。凡涉截杀瑶池青雀火凤、阻挠九天玄女驰援、戕害皇室血脉者，依天条严惩不贷。
二、严惩主谋及党羽
灵焰星君假传天威，勾结阐教玉虚宫，借“缉拿钦犯”之名行屠戮龙族之实，更于九公主临盆之际以雷火大阵阻断东海求援，戕害皇室血脉，险致天家骨血湮灭。其罪上干天怒，下悖伦常，依天条敕令：
着雷部三日后押解至斩仙台问斩，残魄永镇雷池，受万劫雷霆噬心之苦，永世不得超生。
云雷应化天尊执掌雷部枢密，非但纵容灵焰星君僭越弄权，更默许部将截杀瑶池青雀火凤、封锁东海通讯，致使天庭法度沦为屠戮凶器。虽未亲执屠刀，然驭下无方、监察失职，罪同共谋。依天条敕令：
褫夺“应化天尊”封号，剔去仙骨，削千年修为，贬为罪仙，打入天牢最底层，缚于雷刑柱上，日受雷鞭之刑三千年。
此二獠之刑，乃昭示天威不可犯，皇嗣不可欺。凡有假借天条、构陷忠良、危及天家血脉者，无论主谋胁从，皆以此例严惩。
三、拆分雷部权柄
雷部枢密院及三十六雷将助纣为虐，封锁东海、截杀信使，悉数褫夺仙籍，贬为罪仙，押入天牢，余党由北斗监察清查，凡涉罪者同罪论处。
雷部渎职弄权，其天雷调度、缉拿钦犯之职，暂归水德星君统辖，北斗紫微监察协理。待天庭六部重整后，另行分权制衡，永绝权臣祸患。
四、昭雪皇室血脉之冤
赦免东海龙族“私藏钦犯”之诬，敕令司命殿公示雷部罪状，还龙族清白。追封东海殉难水族为“忠烈灵仙”，敕建东海英魂碑，享天庭香火供奉。九公主敖慧赐封“蓬莱护佑龙女”，享双倍仙禄，东海龙宫永世承天恩庇佑。
五、问责玉虚宫
玉虚宫无量仙翁及其门人，勾结雷部构陷天庭重臣，待原始天尊出关后严惩门户，若阐教弟子再涉天廷权争，必以天罚灭其道统。
六、暂押钦犯
敖闰、敖钦、敖顺三龙，屡犯天条，先有屠戮陈塘关之暴行，后勾结玉虚宫无量仙翁，潜入东海构陷龙族，更趁九公主临盆之际妄图戕害皇室血脉，其罪当处极刑，然其身为玉虚宫门人，身负穿心咒及密令符印等阐教罪证，需待元始天尊出关后提审定谳。敕令敖光将三龙押回东海天牢，施锁魂链禁其与外界通联。司命殿会同北斗监察，定期勘验天牢禁制，严防玉虚宫劫狱灭口。三龙生死须由元始天尊亲审后方可定夺，若其道统包庇罪徒，天庭将依天罚问责。
七、封赏东海
东海敖光镇守水境千载，虽遭雷部构陷，然其护持皇室血脉、擒拿钦犯、固守东海之功不可没。东海龙王之职仍由敖光担任，东海龙族自治之权不变，归水德星君统辖，掌人间四时雨露、江河湖海之衡。凡行云布雨、泽被苍生之责，皆由水德星君协同东海龙王共理，以彰其忠正勤勉之德。待封神大战立功后再行封赏，愿敖光感念天恩，恪尽职守，早日位列天庭正神。
若敖光擅专雨令、徇私渎职，水德星君当依天条严惩；若水部借权倾轧东海，敖光亦可直奏紫微监察。
钦此！
——昊天金阙玉皇大帝
至此，震惊三界的诛龙大案彻底清明。经天庭铁腕裁决，主谋极刑伏诛，余党尽数清算，天纲终得昭彰，而人间已历经三月余。
敖光携敖丙，与东海龙族文武官员，立于沧溟台前，身后百丈晶碑新刻“忠烈灵仙”名录，碑下堆满四海水族敬献的祭品。
三月来，我以天庭和龙宫的珍稀药材调理身体，配以二姐所送的，能使人青春永驻的东极净世青莲叶片，身体和法力已恢复如常，并没有留下生育过的痕迹。
我的慧儿，龙族的公主，长得极快，又如哥哥所起的名字一样异常聪慧，现在已经能咿咿呀呀地叫“父王”“母后”，当然，可能和哥哥更有缘分，她最先会叫的，是“哥哥”。哥哥也十分爱她，以至于在东海监理事务期间，每日都要来看她。
殿外的珊瑚丛在夜明珠下泛着柔光，敖丙将最后一卷东海布防图合上，指尖上书卷的墨香未散，人已匆匆穿过回廊。尚未踏入寝殿，便听见内里传来清脆的“咯咯”笑声，伴着奶声奶气的呼唤——“哥哥！”
他掀开珠帘，慧儿正用胖乎乎的小手攥着盘龙冰锤，歪歪扭扭地扑向他。那冰锤本是敖丙镇守东海的法器，此刻却被幼妹当作棒棒糖，玄冰龙纹上还沾着晶莹的口水。我赶紧夺过冰锤，交还到丙儿手里。
“父王总说这冰锤能劈山断海，到了慧儿手里，倒成了磨牙的玩意儿。”敖丙轻笑，俯身将敖慧捞进怀里。慧儿立刻抓住他的手腕，额头晶莹的银鳞蹭过兄长下颌，咿咿呀呀地学舌：“哥哥！糖！糖！”
初云忍俊不禁：“小殿下不喜欢夜明珠，偏对太子的冰锤情有独钟，看来今后也是要舞枪弄棒的！”